Druhá etapa rekonstrukce křižovatky Mileta se bude týkat všech denních a nočních linek MHD, které již během první etapy rekonstrukce křižovatkou projíždějí. Jde tedy o denní linky MHD č. 1, 8, 9, 16, 16Š, 19, 23, 23Š, 24 a 33 a noční linky MHD č. 51 a 52.
Jediné linky MHD, které nebudou druhou etapou oproti stávajícímu stavu dotčeny, jsou noční linky MHD č. 53 a 54 – křižovatkou Mileta již od první etapy neprojíždí, neboť mají výlukovou trasu Brněnskou ulicí a toto opatření bude platit i ve druhé etapě.
Linka MHD č. 8
Trasa linky nebude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), zastávka Heyrovského v Sokolské ulici ve směru na Terminál HD (naproti ČS OMV) bude zrušena a pro II. etapu přesunuta do nové polohy až za křižovatku Mileta,
Linka MHD č. 9
Trasa linky bude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), objízdná trasa povede obousměrně ulicemi Sokolská a Brněnská a linka nebude obsluhovat zastávky Fakultní nemocnice B, Univerzita obrany, Třebeš odbočka, Hvězda, Štefánikova, Velkopopovická, Benešova a Masarykova, na výlukové trase bude linka obsluhovat zastávky Heyrovského v Sokolské ulici (u ČS OMV) ve směru do Malšovic, Hotel Garni a Moravské Předměstí I (ve směru na Terminál HD), linka začne v II. etapě opět obsluhovat zastávku Heyrovského v Sokolské ulici ve směru na Terminál HD za křižovatkou Mileta (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 16
Trasa linky bude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), objízdná trasa povede obousměrně ulicemi Brněnská, Jana Masaryka, třída Edvarda Beneše a Domečkova a linka nebude obsluhovat zastávky Heyrovského, Fakultní nemocnice B a U Dvora v Hradecké ulici, na výlukové trase bude linka obsluhovat zastávky Hotel Garni, Moravské Předměstí I (ve směru do Stěžer), Masarykova a U Dvora v Domečkově ulici (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 16Š
Trasa linky bude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), objízdná trasa povede jednosměrně ulicemi Brněnská, Jana Masaryka, třída Edvarda Beneše a Domečkova a linka nebude obsluhovat zastávky Heyrovského, Fakultní nemocnice B a U Dvora v Hradecké ulici, na výlukové trase bude linka obsluhovat zastávky Hotel Garni, Masarykova a U Dvora v Domečkově ulici (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 18
Trasa linky nebude II. etapou dotčena, linka však bude posílena v úseku Podzámčí – centrum města – Podzámčí z důvodu lepší dopravní obsluhy lokality Hvězda a třídy Edvarda Beneše, když zde nebude v II. etapě vedena linka MHD č. 9 (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 19
Trasa linky nebude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), linka však bude posílena z důvodu lepší dopravní obsluhy areálu Fakultní nemocnice, nebude však ve směru do Fakultní nemocnice obsluhovat zastávky Heyrovského a Fakultní nemocnice B (náhradní zastávky nebudou zřízeny), linka však bude nadále obsluhovat zastávku Heyrovského v Sokolské ulici (u ČS OMV) ve směru do centra města (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 23
Trasa linky bude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), objízdná trasa povede obousměrně ulicemi Brněnská, Jana Masaryka, třída Edvarda Beneše a Domečkova a linka nebude obsluhovat zastávky Heyrovského, Fakultní nemocnice B a U Dvora v Hradecké ulici, na výlukové trase bude linka obsluhovat zastávky Hotel Garni, Moravské Předměstí I (ve směru na Slezské Předměstí), Masarykova a U Dvora v Domečkově ulici (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 23Š
Trasa linky bude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), objízdná trasa povede jednosměrně ulicemi Domečkova, třída Edvarda Beneše, Jana Masaryka a Brněnská a linka nebude obsluhovat zastávky U Dvora v Hradecké ulici a Heyrovského, na výlukové trase bude linka obsluhovat zastávky U Dvora v Domečkově ulici, Masarykova, Moravské Předměstí I a Hotel Garni (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 24
Trasa linky bude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), objízdná trasa povede obousměrně ulicemi Sokolská, Brněnská, Jana Masaryka, třída Edvarda Beneše a Domečkova a linka nebude obsluhovat zastávky Fakultní nemocnice B a U Dvora v Hradecké ulici, na výlukové trase bude linka obsluhovat zastávky Heyrovského v Sokolské ulici (u ČS OMV) ve směru do Třebše, Hotel Garni, Moravské Předměstí I (ve směru na Terminál HD), Masarykova a U Dvora v Domečkově ulici, linka začne v II. etapě opět obsluhovat zastávku Heyrovského v Sokolské ulici ve směru na Terminál HD za křižovatkou Mileta (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 33
Trasa linky bude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), objízdná trasa povede obousměrně ulicemi Brněnská, Jana Masaryka, třída Edvarda Beneše a Domečkova a linka nebude obsluhovat zastávky Heyrovského, Fakultní nemocnice B a U Dvora v Hradecké ulici, na výlukové trase bude linka obsluhovat zastávky Hotel Garni, Moravské Předměstí I (ve směru na Slezské Předměstí), Masarykova a U Dvora v Domečkově ulici (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 51
Trasa linky bude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), objízdná trasa povede jednosměrně ulicemi Sokolská, Brněnská, Jana Masaryka, třída Edvarda Beneše a Domečkova a linka nebude obsluhovat zastávky Fakultní nemocnice B a U Dvora v Hradecké ulici, na výlukové trase bude linka obsluhovat zastávky Heyrovského v Sokolské ulici (u ČS OMV) ve směru do Třebše, Hotel Garni, Masarykova a U Dvora v Domečkově ulici (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 52
Trasa linky bude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), objízdná trasa povede jednosměrně ulicemi Domečkova, třída Edvarda Beneše, Jana Masaryka, Brněnská a Sokolská a linka nebude obsluhovat zastávku U Dvora v Hradecké ulici, na výlukové trase bude linka obsluhovat zastávky U Dvora v Domečkově ulici, Masarykova, Moravské Předměstí I a Hotel Garni, linka začne v II. etapě opět obsluhovat zastávku Heyrovského v Sokolské ulici ve směru na Terminál HD za křižovatkou Mileta (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 53
Trasa linky nebude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), objízdná trasa je vedena jednosměrně Brněnskou ulicí (na lince bude platit výlukový jízdní řád),
Linka MHD č. 54
Trasa linky nebude II. etapou dotčena (oproti I. etapě), objízdná trasa je vedena jednosměrně Brněnskou ulicí (na lince bude platit výlukový jízdní řád).