Znak, který obec dodnes užívá, získalo městečko při povýšení na město dne 21. února 1587. Jelikož je ve znaku obsažen i erb rytířů z Hostouně, kteří hostouňský statek spravovali do 20. let 15. století, můžeme předpokládat, že původní znak získala Hostouň již před tímto datem, snad ve 2. polovině 14. století. Znak tvoří stříbrná hradba s otevřenou bránou, nad níž vystupují 2 věže. Uprostřed nich je umístěn erb, který je z historického hlediska nejzajímavější součástí znaku. Spodní červená polovice znaku upomíná na rytíře z Hostouně, kteří nosili půlený červeno-stříbrný štít. V horní polovici tohoto štítu později obsadil stříbro zlatý rabštejnský lev upomínající na rod, který Hostouň vlastnil v letech 1508-1552. Pravá polovice horní části znaku je vykázána rodovému symbolu Jiřího z Gutštejna, černým jelením parohům položeným na zlatém podkladě. Znakové privilegium z roku 1587, kterým na žádost Jiřího z Gutštejna udělil císař Rudolf II. Hostouni statut města, je uloženo ve Státním okresním archivu v Horšovském Týně.